齦下刮治是否疼痛與病變的嚴重程度等因素有關，一般輕度的牙周炎患者不會疼痛，較嚴重者可能會有疼痛癥狀。齦下刮治是用齦下刮治器，除去附著于牙周袋內根面上的齦下牙石和菌斑，形成具有生物相容性的表面，從而有利于牙周組織的附著和新生。
輕度牙周炎患者，齦下牙石一般附著的位置較淺，并且根面比較平整，此時進行齦下刮治，牙結石一般比較容易去除，通常感覺不到疼痛癥狀；中晚期牙周炎患者由于牙周袋位置較深，牙結石附著比較緊密，并且牙結石的數量比較多，此時進行齦下刮治，患者大多會有疼痛不適的感覺。需要到醫院口腔科進行治療，一般需要在局麻狀態下進行，可有效緩解患者的疼痛癥狀。
此外，齦下刮治是否疼痛，還與醫生的操作有關，如果用力過猛，沒有正確掌握齦下刮治器械的應用方法，沒有嚴格按照齦下刮治器的操作要點進行操作，也會出現刮治疼痛的癥狀，建議選擇正規醫院口腔科進行刮治，專業的醫師操作可以減少疼痛。平時應養成良好的口腔衛生習慣、保持口腔清潔，定期去醫院口腔科檢查牙齒，減少齲壞和牙周病的發生幾率。