寶塔糖指的是磷酸哌嗪寶塔糖，腸蟲清指的是阿苯達唑片，并沒有寶寶打蟲吃磷酸哌嗪寶塔糖還是阿苯達唑片好的這種說法，因為不同的驅蟲藥物有不同的特點和適用情況，建議家長在醫生的指導下給寶寶選擇合適的藥物治療。
在人體腸道內，可能會存在蛔蟲、絳蟲、蟯蟲等多種寄生蟲，如果沒有進行干預，可能引起營養不良，還可能造成腹痛、腹瀉等消化系統不適。而磷酸哌嗪寶塔糖主要用于蛔蟲和蟯蟲感染，服用后使寄生蟲不能附著在宿主腸壁，隨腸蠕動而排出。阿苯達唑片則對多種腸道寄生蟲如蛔蟲、蟯蟲、鉤蟲、鞭蟲等都有較好的驅蟲效果，通過阻斷其對多種營養物質的攝取、吸收，致使蟲體無法生存和繁殖。
如果寶寶明確是蛔蟲或蟯蟲感染，且年齡較小、肝腎功能尚未發育完全，磷酸哌嗪寶塔糖可能是較為合適的選擇。如果懷疑寶寶有多種腸道寄生蟲感染，或者年齡較大、肝腎功能較好，阿苯達唑片可能更為有效。
由于磷酸哌嗪寶塔糖具有潛在的神經、肌肉毒性，不可以過量或者長期使用，在使用時需嚴格按體重用藥。如果寶寶的年齡在兩歲以下，屬于阿苯達唑片的禁忌人群，家長不可以盲目給寶寶應用。