扁桃體結石呈白色或淡黃色，為質地較硬的團塊，通常由扁桃體慢性炎癥引起。
人體扁桃體表面有許多扁桃體隱窩，扁桃體隱窩口開在扁桃體表面是開放的一個個小凹陷，就像橘子瓣的小縫隙。當扁桃體的上皮細胞脫落后，口腔中的死細胞和唾液、食物殘渣、細菌和代謝產物在扁桃體隱窩的引流受阻，這些東西就會及時聚集在扁桃體隱窩里，形成白色的角質化物質，稱為扁桃體結石，像小沙粒一樣的白顏色的、黃色的都有，患者會發現扁桃體表面有白色、黃色的沙粒狀的扁桃體結石。
大多數患者扁桃體結石較小，不會引起任何癥狀，多是在影像學檢查或體檢時偶然發現。少數扁桃體結石較大的患者可出現明顯癥狀，如口臭、長期咽痛、吞咽困難、異物感。
患者沒有任何不適癥狀，大多數的扁桃體結石無需治療；當患者出現明顯癥狀時可采取適合的方法去除，如鉗子夾取、刮除，嚴重者可考慮扁桃體切除術。