跑步時膝蓋疼可能是不當的運動這一非病理性因素造成的，也可能是缺鈣、膝關節炎等病理性因素導致的；如果是非病理性因素，養成良好的生活習慣即可；如果是病理性因素，建議通過相關藥物、手術進行治療。
一、非病理性因素：
患者在跑步的時候膝蓋疼可能是因為運動量過大，或者跑步的姿勢不規范、跑步前沒有做舒展運動等因素造成的。通常屬于正常現象，癥狀不嚴重，也不會持續過長時間。建議患者注意多休息，避免劇烈運動，適當按摩或是熱敷膝蓋，有利于緩解不適。
二、病理性因素：
1、缺鈣：如果患者偏食、挑食造成營養不良，或是鈣攝入不足、缺乏運動等，可能會造成缺鈣，導致骨質脆弱，從而出現膝蓋疼的情況，一般跑步時會加重。建議患者遵醫囑服用葡萄糖酸鈣口服溶液、碳酸鈣D3片等藥物來補充鈣元素，從而改善身體不適。
2、膝關節炎：代謝異常、營養不良、肥胖等因素容易引起膝關節炎，導致患者關節部位疼痛、紅腫以及僵硬，從而出現跑步時膝蓋疼痛的情況。患者可以遵醫囑服用雙氯芬酸鈉緩釋片、布洛芬緩釋膠囊等藥物來消炎、止痛，如果癥狀比較嚴重，需要通過關節融合術、人工關節置換術等方式來治療。
建議患者及時到醫院通過X線檢查、CT檢查、膝關節腔穿刺術等檢查來明確。患者應該清淡飲食，注意營養均衡；注意多休息，避免劇烈運動或過度勞累；保護膝關節，做好防護以及保暖措施。