抗抑郁藥物包括傳統的抗抑郁藥物，及新型抗抑郁藥物，臨床上常用于治療包括抑郁癥在內的抑郁障礙或焦慮障礙患者。部分患者在服用抗抑郁藥時凌晨3點總醒，可能與藥物不良反應、治療不當等原因有關，需明確具體原因進行相應處理。
1、藥物不良反應：部分新型的抗抑郁藥物，例如鹽酸舍曲林、鹽酸氟西汀等，在治療焦慮障礙或抑郁障礙過程中，可以引起患者出現早醒，例如每天凌晨3點總醒，大多情況下發生在抗抑郁藥物治療初期，可能與抗抑郁藥物不良反應有關。在治療早期，使用此類藥物，通過激動患者腦部某些區域的中樞神經遞質受體功能，影響其睡眠節律或生物鐘節律，干擾患者睡眠周期，例如使其睡眠周期提前，增加覺醒時間，引起睡眠不連貫，導致出現早醒癥狀。可咨詢醫生后，幫助調整用藥；
2、治療不當：抗抑郁藥物主要用于治療各種類型的焦慮癥或抑郁癥等精神心理疾病，有時臨床上也用于治療雙相抑郁患者，尤其在單純使用心境穩定劑效果不佳的情況下，可以使用抗抑郁藥物。如果抗抑郁藥物選擇不當，例如劑量偏大，或應用抗抑郁藥物持續時間長，可能導致患者有轉躁狂的傾向，轉躁狂初期首先可以反映為睡眠出現問題，例如每天凌晨3點總醒，有時還可以出現其他的轉躁表現，例如醒后愛忙碌等，需要引起高度重視，及時調整抗抑郁藥物劑量或停藥等；
3、其他原因：臨床上抗抑郁藥物常用于治療抑郁癥，尤其是內源性抑郁癥，內源性抑郁癥患者本身受病情影響，睡眠節律發生紊亂，常見的睡眠障礙表現為晚間睡眠容易早醒。患者服用抗抑郁藥物治療期間，隨著抑郁情緒的改善，入睡困難等睡眠癥狀可以得到改善。但仍然有患者凌晨3點總醒，考慮可能與其病情的復雜性或嚴重性有關。臨床上除了服用抗抑郁藥物改善抑郁情緒外，還需要合并使用抗焦慮藥物以改善早醒癥狀，如枸櫞酸坦度螺酮。