侏儒癥是一種影響身高的疾病，主要由基因突變引起。根據類型不同，它的遺傳方式也有所不同。
如果是隱性遺傳型侏儒癥，通常需要父母雙方都攜帶相關基因才會發病。如果只有一方攜帶，子女一般不會患病。
在你的案例中，你男朋友的父親有侏儒癥，而母親是正常身高，這意味著你男朋友和他的弟弟可能并未繼承父親的致病基因。
因此，你們的孩子也不會因為隔代遺傳而受到影響。
當然，具體情況還需要結合基因檢測和專業醫生的意見。建議在計劃懷孕前進行相關檢查，并定期隨訪。
總之，侏儒癥并不一定會通過隔代方式遺傳給下一代，具體情況因人而異，請遵循專業醫療指導。