一般情況下，與避孕藥相比，避孕套對身體傷害小。
避孕套可以在性生活結束以后與陰莖一起從陰道中撤出，避免精子進入陰道，不但可以起到避孕效果，減少對女性的傷害，還可以起到避免性傳播疾病，比如滴蟲性陰道炎、衣原體性陰道炎、艾滋病等。避孕套一般由乳膠、水溶性潤滑劑等組成，部分人群使用時可能會發生過敏現象，導致出現瘙癢、紅疹等，建議在使用后及時摘取避孕套，護理患部，若不適癥狀嚴重時可遵醫囑服用鹽酸苯海拉明片、鹽酸異丙嗪片、氯雷他定片等藥物進行緩解。
避孕藥雖然也能起到避孕的作用，但其中含有的雌激素和孕激素容易導致女性出現內分泌失調的情況，不利于身體健康。因此，建議性生活時選擇合適的避孕措施，避免發生不良后果。日常注意休息，避免頻繁性生活，多吃新鮮的蔬菜和水果，適當運動增強自身抵抗力。若出現不適，應及時就診。