游泳嗆水后頭疼可能是暫時腦供血不足導致，此外，還可能是神經性頭痛、顱內感染而引起，如果頭疼癥狀持續得不到好轉，或者出現了頭暈、惡心等其他不適癥狀，應及時到醫院就診。
1、腦供血不足：由于游泳嗆水導致機體供氧量不足，并且在嗆水過程中掙扎消耗過多體力，就可能會導致暫時的腦供血不足，腦組織缺氧，出現疼痛不適，此時患者可能會伴有嘴唇發紫、頭暈等癥狀，應及時到氧氣充足的地方休息，一般可以逐漸改善。
2、神經性頭痛：游泳嗆水時情況緊急，神經緊張，加之游泳時水較涼，刺激神經就可能會出現頭疼的情況，特別是對于剛剛學習游泳的人群而言，更容易發生此種情況。建議人們適當休息，深呼吸，調整好心態，并做好保暖工作，可適當按揉頭部，緩解緊張的情緒，癥狀可逐漸好轉。
3、顱內感染：如果泳池的水并不干凈，或者在河中游泳，水中含有大量細菌、寄生蟲等，嗆水后順著鼻腔上行，進入額竇，進一步感染顱腦，可出現頭疼、眩暈、四肢無力、發熱等癥狀，有可能是在游泳嗆水后幾天才表現出上述不適。如果存在細菌感染，可以遵醫囑使用注射用美羅培南、注射用鹽酸去甲萬古霉素等藥物治療。
游泳時可使用鼻夾，特別是對于初學者而言，可以輔助防止嗆水，并且要在干凈、安全的水域進行游泳，游泳后注意保暖，以免著涼而導致自身出現感冒、發熱的情況。