結核菌通常指的是結核分枝桿菌，結核分枝桿菌涂片檢查陰性，提示檢查的標本里沒有找到結核分枝桿菌。但結核分枝桿菌涂片檢查陰性并不代表機體沒有病變，只能代表本次的樣本沒有發現陽性的結果。
臨床上可以通過痰、尿液、糞便、胸水、腹水、腦脊液等各種分泌物、排泄物，以及淋巴結穿刺液的吸引物進行涂片檢查。如果樣本中檢查出結核分枝桿菌，則結果為陽性，提示患者存在結核性疾病。
但如果未檢查出結核分枝桿菌，則結果為陰性，可能是患者不存在結核性疾病，但也可能是疾病不處于炎癥的活動期，或者是已經通過規范的抗結核藥物治療2周以上，病情好轉。因此，結核分枝桿菌涂片檢查可以用來判斷結核病患者是否具有傳染性，以及作為藥物療效的評價指標。
結核病是全身感染性疾病，除牙齒和頭發外，全身各器官組織都可以發病。患者可能會出現盜汗、乏力、食欲減退、發熱、消瘦、體重減輕等癥狀。建議患者積極前往醫院的結核病科就診，除結核分枝桿菌涂片檢查外，還可通過支氣管鏡、胸腔鏡、腹腔鏡等檢查明確。