基因突變乳腺癌復發率較高，臨床上尚沒有確切的數值。若患者沒有進行基因方面的相關治療，根治手術后，相較于其他沒有基因突變的乳腺癌患者可能有著更高的復發率。
抑癌基因較為重要的功能就是抑制不正常或潛在的腫瘤細胞增殖，同時誘導細胞生長停滯，DNA損傷后誘導細胞凋亡，保護遺傳穩定性。基因突變在乳腺癌中廣泛發現，同時發生了基因突變乳腺癌的復發率也會明顯提高。雖然基因突變乳腺癌復發率較高，但也有根據基因突變特有的性質，對乳腺癌患者進行的針對性治療。治療的藥物種類較多，包括傳統的化學治療如鉑類、紫杉醇類，鉑類包括順鉑注射液、卡鉑注射液等藥物，紫杉醇類包括多西他賽注射液、注射用紫杉醇等藥物。
乳腺癌患者早期手術成功后，仍需要定期復查B超等檢查，復查通常間隔3-6個月。一旦復查發現乳腺癌已經轉移，還可以檢測乳腺癌全基因組，分析癌細胞的全部基因突變。為了減少復發的可能，建議患者規律生活作息，飲食方面少食脂肪含量較高的食物，如肥肉、雞爪，可適當補充蛋白質，多吃新鮮蔬菜、水果。
