一代試管嬰兒指的是體外受精胚胎移植，二代指的是卵胞漿內單精子注射，二者的區別包括適應證不同、胚胎培養方式不同、手術方式不同以及費用不同、成功率不同，但并不存在哪一種比另一種更好的情況，如果無法明確選擇何種方式，建議前往醫院由醫生進行明確。
1、適應證不同：前者主要是對輸卵管性不孕癥、原因不明的不孕癥、子宮內膜異位癥等因素導致的不孕加以改善，側重點主要是女性。后者主要用于嚴重少、弱、畸形精子癥、不可逆的梗阻性無精子癥等因素導致的懷孕失敗，側重點為男性。
2、胚胎培養方式不同：前者需要在體外將精子與卵子放在一起培養，使其結合形成受精卵并發育成胚胎。后者需要對取得的卵子去除卵丘顆粒細胞，然后在高倍顯微鏡下進行卵母細胞質內單精子顯微注射授精。
3、手術方式不同：一代試管嬰兒主要使用藥物誘導多卵泡發育成熟后，在陰道超聲指導下進行取卵，培養形成胚胎后再將胚胎裝入細管送入宮腔進行妊娠。二代試管嬰兒是先對精液中的精子進行篩查，然后選取質量較好的精子注射到成熟卵母細胞內，完成體外受精過程，再送入宮腔進行妊娠。
4、費用不同：與前者相比，后者由于存在更多的操作步驟，所以費用可能會貴3000-5000元。
5、成功率不同：一代試管嬰兒的成功率相對比較低，可能在15%-20%之間，而二代試管嬰兒的成功率會相對比較高，可能在50%-60%之間。
對于需要使用輔助生殖技術的人群來講，建議及時前往醫院生殖醫學科就診，配合醫生進行檢查，從而明確選擇何種方式。