吃了益生菌通常還能吃雙歧桿菌，但沒必要再吃雙歧桿菌。兩種藥物作用雷同，只是從藥物性質、藥物成分、治療適應證上面略有不同。除非患者在醫生診治后確定需要二者聯合使用，則可以吃了益生菌后再吃雙歧桿菌，否則沒必要再吃雙歧桿菌。益生菌主要作用是與菌群的消化酶共同參與腸道食物的消化，促進營養物質的吸收，起到調節腸道功能和消化系統的免疫功能，改善腸道功能紊亂或菌群失調所致的排便異常、消化不良等情況。
雙歧桿菌可產生乳酸、醋酸等來降低腸道內酸堿度，起到抑制致病菌生長的作用。一般情況下作用相同的藥物不宜聯合使用，因此，如果吃了益生菌，通常不需要再吃雙歧桿菌。益生菌比雙歧桿菌廣泛，適用于免疫力低下的新生兒消化不良、便秘、腹瀉、消化不良、乳糖不耐受者。雙歧桿菌適用于各種原因導致的急、慢性腹瀉或便秘人群，也可以通過喝酸奶、飲料等補充雙歧桿菌，非嚴重情況下不必益生菌和雙歧桿菌同時吃。