桃仁承氣湯與桃核承氣湯之間的主要差異體現在來源、藥物成分以及功效上都有所不同。
1.來源：桃仁承氣湯這一方劑，其來源是《溫病條辨》一書。桃核承氣湯這一方劑，源于古代醫學經典《傷寒論》，這兩者的來源并不相同。
2.藥物成分：桃仁承氣湯的主要成分包括桃仁、甘草、芒硝和大黃。桃核承氣湯的主要成分包括桃仁、大黃、桂枝、炙甘草和芒硝。這兩種藥物的成分有所區別。
3.功效：桃仁承氣湯主要適用于治療傷寒、蓄血以及熱結膀胱等相關疾病，主要用于治療因傷寒引起的蓄血和熱結膀胱的癥狀，患者表現得異常狂躁，但如果小腹出現結血，下行癥狀則會得到緩解。在臨床上，對于急性盆腔炎、胎盤滯留、附件炎、腸梗阻、子宮內膜異位癥和急性腦出血等疾病，這些都是由于瘀血和熱氣相互結合導致的下焦情況。桃核承氣湯具有消除瘀血和降低體內熱氣的療效，主要用于治療下焦的蓄血癥狀，或產后瘀血內停、腹痛拒按。在臨床上，經常被用來治療急性盆腔炎、胎盤滯留、附件炎、腸梗阻、子宮內膜異位癥和急性腦出血等由于瘀血和熱氣相互結合導致的下焦疾病。
如果需要使用上述的藥方，務必在中醫的辨證論治下進行針對性的治療，以防止藥物使用不當導致病情惡化。