隱匿陰莖常見于先天發育異常和畸形性疾病，其陰莖體縮藏于體內，凸出外面的只有一點包皮，如果用手將陰莖皮膚向內擠壓，陰莖體就會顯露出來，但手稍一放開，陰莖體又回縮了。小兒隱匿性陰莖若能上翻包皮暴露陰莖頭，可不必手術，隱匿陰莖多數能隨年齡增長逐漸好轉，但是若無法暴露，則需手術治療，建議小兒隱匿性陰莖手術時間為學齡前。小兒隱匿性陰莖由于局部異常的解剖因素限制了陰莖前伸，可影響陰莖的發育和以后的正常性生活，建議盡早手術，以免影響其正常生長及發育。并且可避免患兒由于年齡增大看到自己外生殖器和別人不一樣，而產生自卑感和焦慮，學齡前手術也有利于患兒心理健康。
小兒隱匿性陰莖在進行手術后需注意局部護理，由于小兒好動，需時刻注意避免傷口裂開或伸手觸摸手術傷口。術后需配合應用左氧氟沙星等藥物，幫助預防感染，促進疾病恢復。