細菌性痢疾的主要預防通常是管理好傳染源、切斷傳播途徑以及保護易感人群。
1.管理好傳染源：細菌性痢疾一般是由志賀菌屬細菌引起的腸道感染性疾病，其傳染源主要為細菌性痢疾患者及帶菌者。一旦發現以上人群，通常需要盡早進行隔離，并且對此類人群進行救治，直到其糞便培養結果連續2-3次為陰性。
2.切斷傳播途徑：志賀菌屬細菌一般可以通過食物、水源、手或生活用品、昆蟲等方式進行傳播。通常應注意管理好水源、食物等，平時注意防蟲滅蚊，進食前應注意洗手，將細菌性痢疾患者的玩具進行消毒。
3.保護易感人群：學齡前兒童、青壯年人群、老人等人群通常容易患上細菌性痢疾，建議此類人群避免和細菌性痢疾患者及帶菌者接觸，平時注意飲食衛生，盡量吃干凈、衛生的食物。