通常情況下，懷孕三個月哭了可能會對寶寶有胚胎發育、先兆流產等影響，具體內容如下：
1.胚胎發育：孕婦的情緒對寶寶的發育也會存在著聯系，如果懷孕三個月哭了可能會導致內分泌紊亂，從而對寶寶的胚胎發育造成影響，可能會出現寶寶發育不良或者是寶寶發育畸形的情況。
2.先兆流產：懷孕三個月哭了可能會刺激交感神經，孕早期時胎兒還沒完全扎根在母體子宮壁，刺激交感神經后也可能會引起子宮收縮、腹痛等癥狀，從而可能會出現先兆流產的情況。
需要注意的是，懷孕期間孕婦應該調整個人情緒，盡量保持心情愉快，飲食營養要均衡，有利于寶寶的發育，定期做產檢。