腳趾甲發黃通常是多種疾病導致。
真菌感染是常見原因之一，如甲癬，皮膚癬菌侵犯甲板，在甲板內生長繁殖，分解甲板中的角質蛋白，使甲板顏色改變，逐漸變黃、增厚、變形，甲板表面凹凸不平，質地松脆，嚴重時可與甲床分離。長期吸煙也可能引起腳趾甲發黃，煙霧中的尼古丁等有害物質會在指甲上沉積，導致指甲顏色變黃，這種情況下，指甲質地一般無明顯改變，多為均勻性發黃。
另外，患有某些全身性疾病，如黃疸性肝炎、膽囊炎等，由于體內膽紅素代謝異常，膽紅素水平升高，可使腳趾甲及全身皮膚、黏膜發黃，此時常伴有鞏膜黃染、皮膚瘙癢、乏力、食欲不振等癥狀。還有，長期使用某些藥物，如四環素類抗生素，可能導致指甲變色，出現發黃現象，一般在用藥一段時間后逐漸出現。
如果發現腳趾甲發黃，建議及時就醫。醫生會通過詳細的問診、體格檢查以及必要的實驗室檢查，如真菌學檢查、肝功能檢查等，綜合判斷病因。針對不同病因進行相應治療，如甲癬需使用抗真菌藥物，如口服伊曲康唑膠囊、外用鹽酸阿莫羅芬搽劑等；若是全身性疾病引起，則需治療原發疾病，患者需嚴格遵醫囑用藥并定期復查。