使用水銀溫度計一般還與測量部位有關，包括口腔溫度測定、腋下溫度測定、肛門溫度的測定，用法不同。
1、口腔溫度測定：將水銀溫度計放在舌下，用舌頭輕按，然后閉上口腔，5分鐘后就可以讀取結果，通常正常體溫范圍是36.3℃-37.2℃。
2、腋下溫度測定：需要在安靜的情況下測量，然后把水銀體溫計的頂端放在腋下，上臂要適當地夾緊，也不能夾得過緊，以免斷裂，通常10分鐘后可以取出讀取結果，正常腋下的體溫范圍是36℃-37℃。
3、肛門溫度的測定：在測量前，要潤滑水銀溫度計的頭部，然后將其慢慢插入肛門，通常是深1.5厘米，保持3-5分鐘取出，正常溫度范圍一般在36.5℃-37.7℃。
水銀溫度計可以先用酒精棉擦拭，以保證其達到無菌，再將其水銀柱搖動至35℃左右，如不慎觸動，需要再次測溫，以免產生錯誤。