五聯疫苗打上臂，也就是在上臂三角肌的部位注射，對于免疫效果可能會存在輕微的影響。因為上臂三角肌的肌肉面積較小，注射可操作范圍比較小，在衣物的影響下，加之嬰兒不配合，操作起來相對來說比較困難。
而且上臂三角肌的肌肉比較難以定位準備，對于藥物的吸收能力也有限。注射五聯疫苗后，發生局部皮膚紅腫、硬結的可能性比較高。此時也會影響機體對于五聯疫苗的吸收，從而影響機體對于疫苗的免疫反應。
另外，五聯疫苗的說明書上已經明確表明，應注射在嬰兒的大腿股外側肌。大腿外側的股外側肌的肌肉面積較大，操作起來更加方面，附近的血液循環系統也比較豐富，更加有利于五聯疫苗的吸收。而且與注射上臂三角肌相比，機體對于疫苗的吸收率會比較好，發生硬結和紅腫的概率也較低，比較適合月齡較小的嬰兒注射。