一般情況下，沒有“腦干堵塞怎么治療最好”的說法，患者采用溶栓治療、抗血小板聚集治療、降纖治療、神經保護治療等方式是比較好的。具體內容如下：
1.溶栓治療：建議患者在醫生的指導下使用注射用阿替普酶、注射用尿激酶等藥物進行治療，可盡早恢復血流和改善組織代謝情況，促進功能恢復。
2.抗血小板聚集治療：建議患者在醫生的指導下使用硫酸氫氯吡格雷片、西洛他唑膠囊等藥物進行治療，該方法適用于不符合溶栓治療且無出血的腦干堵塞患者。
3.降纖治療：對于血漿纖維蛋白原濃度較高的腦干梗塞患者來說，建議在醫生的指導下使用巴曲酶注射液、注射用降纖酶等藥物進行治療。
4.神經保護治療：由于腦干堵塞對于患者神經的損傷較大，建議患者在醫生的指導下使用依達拉奉氯化鈉注射液、胞磷膽堿鈉氯化鈉注射液等藥物進行治療。