治療強迫癥的藥通常是有副作用的，具體的副作用存在個體差異。
治療強迫癥通常是使用抗抑郁的藥物，能夠調節腦內5-羥色胺等神經遞質的功能，從而達到改善強迫癥狀的作用。常用的藥物有馬來酸氟伏沙明片、鹽酸帕羅西汀片、鹽酸舍曲林片等，常見藥物副作用為惡心、嘔吐、嗜睡、便秘、焦慮不安、疲乏；還可能出現口干、多汗、眩暈、震顫、腹瀉等。強迫癥必要時也可以遵醫囑使用鹽酸普萘洛爾片、勞拉西泮片、奧卡西平口服混懸液等藥物輔助緩解患者焦慮情緒，改善失眠，常見的藥物副作用是嗜睡、頭痛、頭暈、復視、惡心、嘔吐和疲勞等。
服藥期間要清淡飲食，保證足夠的睡眠時間。