牙齒上有個顏色很深的小黃點，可能是氟牙癥、齲齒、牙結石等，原因不同，處理不同。
1.氟牙癥：
多由于攝入了過多的氟導致，可出現牙齒上有個顏色很深的小黃點。氟牙癥的發生主要是因為牙釉質在發育期攝入了過多的氟，氟牙癥的臨床癥狀主要包括著色改變和釉質缺損，一般表現為牙釉質上白堊色或黃褐色的對稱性斑塊，可伴不同程度的牙體缺損。
磨除、酸蝕涂層法即患牙表面均勻磨除約0.1~0.2mm的著色層，酸蝕后涂布粘接劑，保持牙面光滑；復合樹脂修復主要適用于有實質缺損的氟牙癥；漂白術適用于牙體完整無缺損的氟斑牙。在牙面上涂布美白的凝膠，在冷光照射下使牙面著色層脫色。
2.齲齒：
齲病患者的牙齒在發病早期可能會出現白色斑塊或黃褐色斑點，可出現牙齒上有個顏色很深的小黃點。健康的牙齒表面應該是完整、光滑、有光澤的。此時患者一般無自覺癥狀。中期以后患者會出現對冷、熱、甜、酸敏感的現象，同時牙齒外觀上會發現有齲洞。
刷牙、使用牙線、間隙刷、餐后漱口等方法有效清除菌斑；健康飲食，控制糖的攝入，減少糖的進食頻率，進食后要清水漱口或刷牙，鼓勵進食含纖維的食物；氟化物使用氟化物防齲，常用的氟化物有75％氟化鈉甘油糊劑、8％氟化亞錫溶液等。
3.牙結石：
細菌與食物中的蛋白質和分解過程中產生的副產品混合，形成一種叫作牙菌斑的黏性薄膜，它會附著在牙齒及填充材料上。可出現出現牙齒上有個顏色很深的小黃點。
牙齒表面附著的牙菌斑沒有及時清理，就會變硬形成黃白色至棕黑色牙石，沉積在牙齒上特別是牙頸與牙齦交界處。其表面會聚集細菌，刺激牙齦，引發牙齦炎，導致口臭、牙齦紅腫、出血等癥狀。
牙結石的治療主要分為兩方面：一方面是對菌斑的控制如齦上潔治術、齦下刮治術，以減少牙結石的形成和細菌對牙齦的侵害；另一方面用潔治的方法清除附著在牙齒表面的牙結石。防治結合才能更好的達到治療效果。
以上藥物需要在醫生指導下用藥，切不可盲目服用。