指甲皺巴巴的、凹凸不平可能是甲癬、糖尿病、甲溝炎等疾病所致，可通過改善生活習慣、使用藥物等方式來進行治療，具體分析如下：
1.甲癬：甲癬是一種好發于手指甲板和腳趾甲板的感染性皮膚病，表面缺乏光澤，呈褐色、深褐色，甲下有角質堆積物，出現甲板部分缺損的情況，從而導致指甲皺巴巴的、凹凸不平。甲癬患者平時的飲食應以清淡為主，避免食用辛辣刺激的食物，多喝水，注意休息，還可以在醫生的指導下使用酮康唑乳膏、伊曲康唑膠囊、氟康唑膠囊等藥物進行治療。
2.糖尿病：糖尿病可能會導致身體缺乏維生素B族、礦物質等營養物質，從而導致指甲營養不良，出現指甲皺巴巴的、凹凸不平的情況。糖尿病患者的飲食一定要低糖、低鹽、低脂，還可以在醫生的指導下使用二甲雙胍片、格列齊特片、格列美脲片等藥物進行治療。
3.甲溝炎：甲溝炎是指甲溝部位產生的炎癥，可出現局部化膿、感染等情況，指甲縫里得不到充分的清潔，導致細菌積聚過多，從而導致指甲皺巴巴的、凹凸不平。建議每晚泡腳，平時穿透氣的鞋子，保持腳部清潔衛生，還可以在醫生的指導下使用紅霉素軟膏、阿莫西林片、羅紅霉素片等藥物進行治療。