例假過后小肚子底部隱隱作痛，考慮可能與經期受涼、飲食不潔等非疾病因素有關。另外，盆腔炎、子宮內膜異位癥以及急性腸炎、膀胱炎等疾病也可能引起上述癥狀，建議患者及時就醫，明確診斷。
一、非疾病因素：包括經期受涼或攝入生冷、辛辣等不潔飲食等因素，此時可能出現例假過后小肚子底部隱隱作痛。建議做好小肚子的保暖，不宜長期待在寒冷、潮濕的環境中，飲食不可貪涼，避免不健康的飲食習慣，注意休息。
二、疾病因素：1、盆腔炎：因為月經期子宮口開放，如果有細菌感染，容易通過宮頸口進入到宮腔，再通過宮腔進入到盆腔，造成盆腔慢性炎癥，會導致例假過后小肚子底部隱隱作痛，可遵醫囑口服抗生素，如甲硝唑、克林霉素、頭孢他定、阿奇霉素、米諾環素等治療；
2、子宮內膜異位癥：子宮內膜異位癥是指子宮內膜種植到宮腔以外的位置上，可出現例假過后小肚子底部隱隱作痛。子宮內膜異位癥可給予孕激素、口服避孕藥等藥物治療，必要時可以通過手術治療切除病灶；
3、急性腸炎：由于細菌或病毒感染導致，除例假過后小肚子底部隱隱作痛之外，常伴有腹瀉、惡心、低熱、頭疼、乏力等癥狀，可遵醫囑使用環丙沙星、諾氟沙星等藥物進行抗菌治療，以及蒙脫石散、洛哌丁胺等藥物進行止瀉治療；
4、膀胱炎：由于炎癥刺激膀胱黏膜，也可能出現例假過后小肚子底部隱隱作痛的癥狀，多伴尿痛、尿道灼燒感、尿異味等癥狀，可在醫生指導下使用頭孢克洛、氧氟沙星、環丙沙星等藥物治療，并注意休息、多飲水。
此外，中醫認為例假過后小肚子底部隱隱作痛與氣血不足、體質虛弱有關，可在中醫指導下服用八珍益母丸、艾附暖宮丸等中成藥補氣養血，緩解癥狀。