一般情況下，心臟彩超可以觀測缺損的形狀測量缺損的面積，指導治療。目前的治療方法主要有兩種：
介入治療和外科開胸手術治療。大多數房間間隔缺損采用蘑菇傘式封堵器進行修補，這種方式具有很低的危險性和低的并發癥，是當前較為流行的一種治療方式。對于房室間隔缺損的修復，可以采用外科手術。手術后患者在監護室進行心電圖、血壓和呼吸的監測，除顫儀應隨時處于備用狀態。對于嚴重泵衰竭者還需監測肺毛細血管壓和靜脈壓。