刺五加的種子通常不作為中藥，因此其通常不具有特殊藥用價值。
刺五加的主要藥用部分為曬干的根或根莖，其口感甘中帶微苦，入脾、肺、心經，具有顯著的益氣健脾作用，能調和脾胃功能，同時補腎并有助于安神寧心。臨床應用廣泛，適用于脾肺氣虛導致的乏力、食欲減退，以及腎虛引發的腰膝酸軟、失眠和記憶力下降等癥狀。但是，刺五加的種子并不是一種中藥，不具有藥效，無法治療疾病。
注意，發熱人群應避免食用刺五加；體質陰虛火旺，或對刺五加過敏者嚴禁使用。服藥期間應保持飲食清淡，遠離生冷和難以消化的食物。在服用刺五加期間若感不適，建議立即就醫，建議經中醫師診斷后使用，切勿擅自使用。