藿香正氣丸和加味藿香正氣丸區別通常是藥物成分不同和治療病癥不同，在用藥時候必須謹遵醫囑。
1.成分不同：藿香正氣丸里面主要成分是廣藿香、蒼術、白芷、陳皮、茯苓等，而加味藿香正氣丸里面成分是廣藿香、紫蘇葉、陳皮、半夏等，這兩種藥物里面所含成分不一樣，在用藥時候要嚴格聽從醫生指導，因為都是中藥，所以在服用期間盡量減少吃刺激性食物，避免藥物產生沖突，影響到藥效。
2.治療病癥不同：藿香正氣丸和加味藿香正氣丸，對應病癥也可能會不同，加味藿香正氣丸經常用于外感風寒、內傷濕熱、頭重頭痛等不良癥狀，而藿香正氣丸經常用于暑濕感冒所引起的胸悶、頭痛、發熱等不良表現。