藿香正氣丸通常不建議與消炎藥物同時服用，如果需要聯合用藥，應遵醫囑。
消炎藥物中含有10%至30%的酒精，因此在服用藿香正氣丸期間，盡量避免同時使用消炎藥物，特別是頭孢克洛膠囊、阿莫西林膠囊等，以及頭孢類的頭孢克肟片、頭孢呋辛酯片等藥物，以免酒精與這些藥物發生相互作用，可能對身體產生不良影響，如引發雙硫侖樣反應，導致頭暈、頭痛、呼吸急促、呼吸困難等癥狀的出現。
為確保用藥安全，平時在服用藥物時，務必咨詢專業醫生，了解藥物之間的相互作用及可能產生的不良反應。在用藥之后，多喝水可以幫助促進身體代謝，有助于減少藥物可能帶來的不良影響。