馬蹄腎兒童通常能夠健康長大。馬蹄腎屬于腎臟病中先天性畸形疾病，一般情況下，腎功能和常人無異，對兒童的身體發育不會有太大影響。如果受到外界刺激，如勞累或者工作壓抑，很容易出現腰酸背痛及泌尿系統感染的問題。但是兒童不會出現太多臨床表現，或現臨床表現比較輕微，一般不需要給予任何治療，定期觀察即可。
如果馬蹄腎兒童出現尿路感染以及結石等，需要及時進行醫治，到專業的醫院進行檢查，常見的檢查有血常規、尿常規、肝功能、腎功能以及雙腎輸尿管膀胱彩超等。完善相關檢查后，需要對癥給予用藥治療，可遵醫囑給予鹽酸貝那普利、黃芪顆粒等藥物治療。除此之外，家長也需要積極配合醫生，做好兒童護理，讓兒童吃清淡的食物，注意多休息，減少劇烈運動。