雙側上頜竇炎一般可以使用藥物進行治療，當藥物治療無效時可以考慮手術治療。
藥物方面患者可以使用鼻內用減充血劑，如呋麻滴鼻液、賽洛唑啉鼻噴劑等，對減輕鼻腔及竇口黏膜腫脹，改善竇口引流有顯著作用。還可以用糖皮質激素噴鼻，如布地奈德鼻噴霧劑、糠酸莫米松鼻噴霧劑等，可以起到抗炎、抗水腫的作用。患者也可以用生理鹽水、高滲鹽水等進行鼻腔沖洗，每天一至兩次，有助于清除鼻腔內的分泌物，改善黏膜的微環境。在全身癥狀消退或局部炎癥基本控制之后也可以進行上頜竇穿刺沖洗，每周沖洗一次，直至無膿液沖洗出為止。每次沖洗后可向竇內注入抗生素替硝唑或者甲硝唑溶液，部分患者一次沖洗即可痊愈。
如果患者使用藥物治療無效，可以選擇手術治療，手術方式有上頜竇造瘺術、經唇齦溝下鼻道上頜竇造瘺術、上頜竇根治術等。
建議患者平時清淡飲食，規律作息，應避免接觸過敏原，如果出現咽喉或鼻部不適應及時就診，炎癥發作期間睡覺時可以將頭部太高，從而幫助緩解不適癥狀。