短指癥可能會有關節易受損傷、自卑感、運動能力下降等危害。
1、關節易受損傷：短指癥是一種常染色體顯性遺傳病，是指跖骨短小甚至消失，一般以第四跖骨短小者居多，也偶有發第一跖骨短小癥。短指癥導致受影響的指頭在外觀上較為縮短，手指末端的關節易受損傷。
2、自卑感：短指癥可能會影響手部的外觀，使得患者的心理受到影響和傷害，出現自卑感。
3、運動能力下降：短指癥對行、跑、走、彈跳等足部動作的完成有一定影響，也常造成運動能力下降，引起應力分布不勻。
短指癥還可能會出現關節部疼痛、平衡感下降、關節變形等危害，需要積極對癥治療。