肝疼，然后腰特別疼可能是病毒性肝炎、肝硬化、肝癌等因素引起的，同時腰特別疼也可能是同時存在腰肌勞損、腰椎間盤突出癥等病癥，可以通過一般治療、藥物治療、手術治療等方式進行處理。
1、病毒性肝炎：病毒性肝炎是由多種不同肝炎病毒引起的一組以肝臟損害為主的傳染病，可能會導致肝區疼痛、食欲減退、惡心、嘔吐等不適癥狀，而疼痛嚴重的情況下可能會向腰部輻射。建議患者按醫囑服用拉米夫定片、恩替卡韋片等抗病毒藥物進行治療。
2、肝硬化：肝硬化是一種常見的由不同病因引起的慢性、進行性、彌漫性肝病，可能會出現肝脾大、黃疸、肝掌等不適癥狀，隨著病癥的加重，可能會導致肝區甚至腰背部疼痛。建議患者按醫囑服用安絡化纖丸、肝健膠囊等利肝藥物進行治療。
3、肝癌：肝癌是發生于肝臟的癌病，可能會出現肝區疼痛、腹脹、納差、乏力、消瘦，疼痛可能會輻射腰背部，癌細胞也可能會向腰背部轉移，進而出現腰疼的情況。建議患者通過根治手術、放化療等方式進行處理。
4、腰肌勞損：如果患者存在上述病癥的同時還伴有腰肌勞損，則可能會導致腰部劇烈疼痛的情況，還可能會出現瘀青、紅腫等不適癥狀。建議患者按醫囑服用布洛芬片、塞來昔布膠囊等抗炎鎮痛的藥物進行治療。
5、腰椎間盤突出癥：腰椎間盤突出癥是因腰椎間盤勞損變性、纖維環破裂、髓核組織突出刺激或壓迫相應水平的神經根、脊髓等引起的綜合征，可能會出現腰部劇痛、下肢放射痛、間歇性跛行等不適癥狀。建議患者通過按摩、推拿、牽引療法等方式改善不適癥狀，必要時可以通過經皮腰椎間盤摘除術、椎間孔鏡治療腰椎間盤突出等方式進行處理。
此外，肝疼，然后腰特別疼還可能與膽囊炎有關，建議患者及時前往醫院就診，通過超聲、CT等方式了解病癥情況，然后對癥處理。同時注意休息，避免劇烈運動和過度勞累，避免進食辣椒、洋蔥等刺激性較強的食物。