早上起來肝疼，一會就不疼了，可能為膽囊疾病、肝臟疾病所致，如膽囊炎、脂肪肝、肝炎、肝硬化等，建議患者及時前往醫院就診，遵醫囑通過超聲、血常規、肝功能等檢查來查找原因，并遵醫囑治療。
1、膽囊疾病：如果患者長期起床較晚，或者早飯進食時間較晚，導致膽汁淤積于膽囊，可能會刺激膽囊而誘發膽囊炎、膽囊結石等膽囊疾病。如果患者進食早餐不及時，膽汁可能會刺激膽囊而導致疼痛，進食后多可逐漸緩解。由于膽囊位于肝下，患者定位疼痛部位時易混淆，可能會表現為早晨起來肝疼，一會就不疼了。此時需遵醫囑應用利膽片等藥物來幫助緩解炎癥，或者通過激光碎石等方法去除膽囊結石；
2、肝臟疾病：多與嗜食肥甘肉厚、過量飲酒、病毒感染等因素有關，可能會導致肝炎、脂肪肝、肝硬化等肝臟疾病，致使肝臟功能異常而出現食欲不振、惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀。患者處于疾病急性期時，可能會因體位變化而刺激肝臟，導致早晨起來肝疼，一會就不疼了。此時需要遵醫囑使用注射用還原型谷胱甘肽、注射用復合輔酶等藥物進行治療，保護肝臟功能，同時可在醫生指導下使用恩替卡韋片、富馬酸丙酚替諾福韋片等藥物進行抗病毒治療，必要時需進行經頸靜脈肝內門體靜脈內支架分流術等手術治療。