山泉水大多是地下水從地表裂隙自動流出的水，看起來很清澈，但是長期飲用容易導致消化道不適，還可能造成重金屬攝入超標，甚至造成礦物質中毒。
有些山泉水是淺層地下水，含水層的上面只有土壤覆蓋，其水質易隨外界環境因素的影響而波動。如在大雨后，會將地面上的化肥、農藥、細菌、病毒等各種污染物帶入淺表含水層，因而從淺層地下水流出的山泉水的細菌總數、大腸菌群數和理化特征等衛生指標，通常不能達到國家飲用水衛生標準，長期飲用可能會出現腹痛、腹瀉等癥狀。
如果山泉水是深層地下水，上面由于有巖石等不透水層的隔絕，故受外界直接污染的機會較少，水質較穩定，但其水質與所在的地層結構和組成有密切關系。如果地層中含有較多的鉛、砷、汞、氟、放射性物質等成分，則流出的山泉水很可能會含有這些物質，長期喝可能會造成礦物質輕微中毒。
因此可以少量地喝山泉水，在喝山泉水的時候可以將水加熱，同時避免一次性喝太多，也不建議長期喝山泉水。