黑芝麻加蜂蜜一般可以選擇在早晨食用，也可以選擇在晚上食用。黑芝麻和蜂蜜的營養互補作用非常明顯。不論何時食用，都能充分利用這兩者的優勢，同時也不會對功效產生負面影響。
早晨空腹時，胃腸經過一夜的休整，吸收功能較好。此時食用黑芝麻加蜂蜜，黑芝麻的營養成分可以被充分吸收，為身體提供能量和滋養。同時，蜂蜜的潤腸作用有助于促進腸道蠕動，預防便秘。晚上睡前食用黑芝麻加蜂蜜，有助于舒緩神經，促進睡眠。黑芝麻的滋補作用可以在夜間為身體進行修復和調養，而蜂蜜則能起到一定的安神作用，幫助放松身心，進入良好的睡眠狀態。
然而，也需要注意，雖然黑芝麻和蜂蜜都是營養豐富的食物，但過量食用可能會導致消化不良等問題。因此，應控制食用量，不宜過多。對于胃腸虛弱的人，早晨空腹食用可能會引起不適，可以在飯后適當食用。同時，大便不成形人群、痰濕體質、氣虛人群以及對黑芝麻或蜂蜜過敏的人群也不適合食用。