指甲凹凸不平、發黃、增厚，可能是外傷、指甲營養不良、甲癬等原因引起的，需要通過日常護理、藥物治療的方式進行治療。具體內容如下：
1、外傷：若患者不留意周圍情況，可造成指甲與堅硬物品發生碰撞，可能會出現指甲凹凸不平、局部瘀血、指甲變黃、增厚等癥狀。建議患者通過先冷敷后熱敷的方式來緩解病情，平時要注意手部的清潔，避免患處再次受傷。
2、指甲營養不良：先天性指甲形成不全，或者后天指甲營養障礙均可導致本病，其特征是指甲變薄、混濁、脆弱，還伴有上述癥狀。建議患者遵醫囑服用維生素A糖丸、維生素E軟膠囊等藥物進行治療，平時注意飲食營養均衡攝入。
3、甲癬：若患者不注意手部清潔，受真菌感染可誘發甲癬，其特征是指甲混濁、增厚、表面凸凹不平、變脆、變黃、易破損等。建議患者遵照醫囑使用抗真菌藥物來治療，如鹽酸特比萘芬乳膏、鹽酸伊曲康唑膠囊等，有利于控制病情。
除上述原因外，還有可能是其他因素導致的，例如扁平苔蘚、銀屑病、缺硫性毛發營養不良病等，患者需要盡快就醫，明確診斷后進行合理的治療。