大薊和小薊的區別包括植株、葉片、花序、功效、適應證，使用時應嚴格在醫生指導下進行，避免擅自使用。
1、植株：大薊植株較大，圓柱形，表面有縱棱，能生長至1.5m，但一般都是在花期才會生長較高，平時則是貼地生長。小薊植株高度可達1-2米，莖直立，通常有刺。
2、葉片：大薊葉片兩面同色，綠色，葉片淺裂至羽狀深裂或近全裂，葉緣有大小不等的鋸齒，且有大小不等的針刺及刺齒。小薊葉多皺縮或破碎，完整者展平后呈長橢圓形或長圓狀披針形，上表面綠褐色，下表面灰綠色，兩面均有白色蛛絲狀毛。
3、花序：大薊頭狀花序單生或1-2個集生于枝端，密被綿毛，球形，無梗或有短梗，全為管狀花，花為紅色；花冠暗紫色。小薊頭狀花序頂生，總苞鐘狀，苞片黃綠色，線形或披針形，花冠多脫落，冠毛羽狀常外露。
4、功效：大薊具有較強的消腫力量，主要用于散瘀消腫；小薊則用于血淋、血尿的作用較強，還有利尿通淋的功效。
5、適應證：大薊還可用于外傷出血，兼療癰腫，而小薊專主血，不能消腫。
在使用這兩種藥材時，需要根據具體的病情和個體情況，結合醫生的建議，合理搭配和使用，以達到最佳的治療效果。