高原反應牙疼可能是氣壓過低、牙神經受刺激、牙齒敏感、牙齦炎、急性牙髓炎等引起的，需要根據實際情況處理。
1、氣壓過低：牙齒內部含有豐富的血管，如果患者有輕度的牙髓病變而沒有發現，當進入高原地區時，牙髓組織中的氣壓過低可使牙髓內壓力增高，比較容易出現疼痛癥狀。這種情況一般不嚴重，注意觀察情況即可。
2、牙神經受刺激：因為高原反應會引起多個組織器官缺氧，有可能會影響牙神經，從而引起牙疼，需要暫時脫離高原環境，如果不再缺氧，牙疼的癥狀一般就會消失。
3、牙齒敏感：牙齒敏感是指牙齒受到外界刺激出現的短暫、尖銳的疼痛或不適的現象，比如機械摩擦或咬硬物、冷熱刺激、滲透壓等，疼痛隨著刺激的來臨和離去而迅速出現和消失，受高原氣壓、冷空氣的影響也是如此。嚴重時患者可以采用激光治療、嵌體冠修復等方式保護牙齒。
4、牙齦炎：該病的典型癥狀為牙齦色澤改變、組織水腫、疼痛等，長期的炎癥刺激可能會引起口臭、牙齦和牙齒疼痛等，發生高原反應后癥狀容易加重。患者可以遵醫囑使用過氧化氫溶液、氯己定含漱液等藥物治療，促使炎癥消失；若牙齦形態不能恢復，建議進行牙齦成形術。
5、急性牙髓炎：該病是由細菌感染引起牙髓組織的急性炎癥，少數時候也與高原地區的氣壓有關，通常發作比較急，容易出現明顯的牙齒疼痛癥狀。患者可以遵醫囑使用阿司匹林片、對乙酰氨基酚片等藥物進行治療，及時止痛，必要時進行根管治療。
除上述常見原因之外，還有其他相對常見的原因，比如急性根尖周炎、智齒冠周炎、逆行性牙髓炎等。如果患者發現牙齒疼痛，在冷、熱、酸、甜的刺激下癥狀更加明顯，應該及時就醫，通過血常規、口腔頜面部檢查、口腔X光片檢查等方式明確情況。平時的飲食宜清淡，多吃小米粥、面條等清淡的食物，加強口腔清潔，飯后刷牙、漱口。