懷孕39周牙疼的厲害，需要及時進行止痛，可以通過一般的治療措施來恢復健康，比如濃鹽水漱口、冷敷鎮痛、控制飲食等。但如果疼痛比較劇烈，一般治療措施無法緩解的情況下，可以在醫生的指導下采取門診的一些治療措施，比如藥物治療、手術治療等。濃鹽水具有一定的殺菌作用，孕婦可以適當用一些濃鹽水來漱口，可以在一定程度上緩解疼痛的感覺，但是無法治療引發疼痛的疾病。懷孕39周牙疼時，如果出現面部腫脹的情況，也可以用冷水、冰塊進行冷敷，以達到鎮痛、消腫的目的。如果是齲洞引起的牙疼，飲食應該以清淡為主，避免食用辛辣刺激性的食物，以免使不適的癥狀加重。
如果疼痛非常劇烈，也可以在醫生的指導下服用一些止疼消炎的藥物進行治療，例如阿莫西林膠囊、阿奇霉素膠囊等，通過減輕炎癥來緩解疼痛，但是藥物服用需要嚴格的控制用量，不可以私自使用，以免對胎兒造成不利影響。如果牙疼伴有嚴重的牙齦腫脹時，必要時還需要手術切開引流，減輕髓腔內的壓力，但不建議補牙、根管治療以及拔牙，以免產生不良的影響。
另外，孕婦在懷孕期間如果出現牙疼的癥狀時，要注意口腔內的清潔，避免吃太冷、太熱、太酸、太甜的食物，以免加重牙疼的癥狀，在飲食上也不能吃太硬的食物，可以適當吃一些半流質或者流質的食物。