子宮內膜的復雜性不典型增生被認為是癌癥的前期病變一般屬于良性疾病。臨床上出現癥狀后，女性多表現為不孕或者流產等現象，并且隨著病情加重會有癌變可能。在這種情況下，雖然病變還沒有進展到子宮內膜癌，但惡變的可能性很高，因此應該積極治療，通常可以治愈，治療方法可以選擇藥物治療或手術治療，需要及時就醫進行治療。
如果生育已經完成，可以考慮進行子宮切除手術，可以實現子宮的治愈。對于年輕且沒有生育歷史的女性，如果女性想要維持生育能力，可以按照醫生的建議長時間口服高效孕激素，這有助于逆轉內膜的病變。目前對于絕經前后女性的處理主要是以保守為主，包括雌激素替代和雄激素替代療法等。通常，女性需要連續服用3-6個月，隨后進行宮腔鏡下的子宮內膜活檢或診斷性刮宮，以確認內膜的病變是否已經得到逆轉。如果是良性增生和不典型增生等病灶，可以選擇保守治療或者手術治療。如果病情已經得到逆轉，這意味著已經完全康復，無需進行手術治療。然而，如果藥物治療的效果并不理想，仍然建議進行手術治療以實現治愈。
患有子宮內膜復雜性不典型增生的女性，在日常生活中應當避免攝入雌激素含量較高的食品，例如阿膠和蜂王漿，同時也應避免食用辛辣食品，例如麻椒、生蒜和白酒等。對于有痛經癥狀者可服用中藥進行治療，以緩解疼痛。在此期間，應當按照醫生的建議定期進行復查。