腳趾甲剪太短旁邊肉一碰就疼可能是外傷、甲溝炎、甲癬等因素引起的，建議及時的進行針對性治療。
1、外傷：如果剪指甲的時候傷害到了甲周的軟組織，此時會誘發疼痛。建議及時用碘伏消毒，以免誘發感染。
2、甲溝炎：甲溝炎通常是金黃色葡萄球菌、化膿性鏈球菌等細菌感染引起的，常見的癥狀為指甲旁邊的肉發紅、腫脹、疼痛?？勺襻t囑外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏等藥物消炎。
3、甲癬：甲癬主要是皮癬菌、酵母菌等真菌引起的。甲床會增厚變形，指甲周圍局部組織按壓疼痛。建議及時遵醫囑服用鹽酸特比萘芬片、鹽酸伊曲康唑膠囊等藥物來治療。
此外，該情況也可能是化膿性指頭炎引起的，建議及時就診治療。恢復期間要多喝水，多吃新鮮的蔬菜水果。