肛門括約肌痙攣是否能自愈與病因有關，若為生理性因素所致一般能自愈，而與病理性因素有關者則需積極就醫診治，雖不能自愈但大多能治好。
1、生理性因素：若肛門括約肌痙攣與精神緊張、過度吃辛辣刺激性食物等因素有關，到醫院檢查并無器質性病變，通常不需采取特殊治療，大多可以自愈，注意消除緊張、平復心情、清淡飲食等即可；
2、病理性因素：如腸壁神經節細胞缺如、局部感染等，此種原因所致肛門括約肌痙攣不能自愈，建議盡快明確診斷，根據個體情況通過針灸、按摩、直腸平滑肌部分切除術等措施進行治療，或遵醫囑聯合使用痔瘡膏、麝香痔瘡栓等藥物，以治療疾病。
肛門括約肌痙攣者日常需避免吃辛辣、煎炸食物，禁抽煙、喝酒，多進食粗纖維食物，積極進行干預，以免生理性因素所致肛門括約肌痙攣長期未治療，引發肛門括約肌增生、肥厚，轉變為器質性病變。