臨床上宮腔鏡檢查一般會比取卵疼痛，通常宮腔鏡檢查是進行局部麻醉，所以患者會有一定痛覺。而取卵通常用的是靜脈麻醉，屬于全身麻醉，患者一般不會有痛覺。
宮腔鏡檢查一般采用局部麻醉，在宮頸局部進行麻醉可以減少疼痛，若個別患者對疼痛較敏感，器具進入到宮腔時，可能會引起疼痛，并且當器械接觸到子宮壁時，會刺激子宮從而引起子宮收縮導致疼痛。而大部分取卵每次需要取8-10個，雖然穿刺針相對比較細，但不打麻醉時比較疼，一般需要在全麻下取卵，因此全麻下取卵沒有宮腔鏡檢查疼痛。
如果對疼痛相對比較敏感的患者，可以在做宮腔鏡檢查時要求全麻，避免由于疼痛影響檢查順利進行。無論是宮腔鏡檢查還是取卵，都建議在手術后留院觀察1小時以上，沒有不舒服情況再離開醫院，并且日后應嚴格按照醫生醫囑進行護理。