打完HPV疫苗后手臂肌肉疼痛可能是一種正常現象，還可能與感染、過敏等原因有關，建議患者根據病因進行治療，具體內容如下：
1.正常現象：打HPV疫苗時一般會在手臂進行，可能會導致患者出現手臂肌肉酸痛的情況，但持續時間一般較短，通常是一種正常現象，一般可以自行恢復，不用進行特殊治療。
2.感染：如果患者在打完HPV疫苗后，導致接種部位沾水，可能會出現感染，從而導致手臂肌肉疼痛，患者一般可以在醫生的指導下使用阿莫西林膠囊、頭孢克肟分散片、青霉素V鉀分散片等藥物進行治療，建議患者在打完HPV疫苗后24小時內，盡量避免洗澡，以免病情加重。
3.過敏：如果患者對HPV疫苗過敏，可能會出現打完HPV疫苗后手臂肌肉疼痛，患者一般可以在醫生的指導下使用氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片、爐甘石洗劑等藥物進行治療，緩解不適。