一般情況下，6歲兒童頭骨凹凸不平可能是缺鈣、狹顱癥、外傷等原因導致的，需要根據病因，對癥治療。具體分析如下：
1.缺鈣：6歲兒童長期挑食或偏食，可能會使攝入的鈣不足，容易導致缺鈣，長期如此，可能影響到頭骨的正常發育，從而引起頭骨凹凸不平。6歲兒童應該遵醫囑使用小兒碳酸鈣D3顆粒、碳酸鈣片、葡萄糖酸鈣顆粒等藥物進行治療；在日常生活中注意多曬太陽。
2.狹顱癥：6歲兒童如果顱縫過早骨化，容易導致顱腔容積減小、形態異常，不能適應頭部的正常發育，從而引起頭骨凹凸不平。6歲兒童可以通過顱骨修補術進行治療；平時盡量避免劇烈運動，注意保護頭部。
3.外傷：如果6歲兒童頭部受到鈍器或尖銳物品撞擊，可能會使頭骨受到損傷，形成凹陷性骨折，從而引起頭骨凹凸不平。6歲兒童可以通過清創術、顱骨成形術等方式進行治療；平時多注意休息，不要過度勞累。