染色體倒位是可以生孩子的，但是生正常孩子的概率比較低，而且容易不孕，在孕期發生不良妊娠的概率會更大，比如出現復發流產、胎停育等。
染色體倒位是比較常見的一種染色體多態，其攜帶者臨床表現和正常人無異，但在生育期男性容易發生精子異常造成不育，女性容易發生不孕，即便懷孕，隨后發生不良妊娠的概率也比較高。染色體倒位的生育異常、臨床癥狀輕重，和發生倒位的染色體種類，以及是否有倒位染色體片段基因重復或丟失多少都有關系。若基因片段丟失或者重復比較多，自然受孕并且生育正常孩子概率就會比較低。臂間倒位的染色體在減數分裂時會形成倒位環，分離后有四種配子，只有一種正常，一種倒位，另外兩種為不平衡染色體，其中一種可能丟失，另一種難于存活而致早期流產或胎停育。
由此可見，染色體倒位攜帶者也能生育正常的孩子，只是概率低而已，只有1/4的概率。所以如果夫妻雙方在檢查染色體時，發現有染色體倒位，最好是做輔助生殖技術中的三代試管嬰兒，在胚胎移植以前就進行染色體分析，選擇正常染色體的囊胚移植，增加生育正常孩子的概率。