肚子疼一般指腹痛，一般情況下，晨跑腹痛可能是沒有做好熱身、胃腸痙攣、腸炎等原因引起的，需要積極進行對癥治療。
1、沒有做好熱身：如果在晨跑前沒有做好充分的熱身準備，就可能會導致腹部肌肉受到刺激，導致局部肌肉痙攣，從而導致腹痛的癥狀，適當休息后可以緩解。
2、胃腸痙攣：如果室外空氣比較寒冷，在晨跑過程中吸入大量的冷空氣，就可能會刺激胃腸道，導致胃腸痙攣，出現腹痛、腹脹等不適癥狀，一般不需要特殊治療，注意休息即可。
3、腸炎：該疾病可能會引起腸道黏膜炎癥反應，在劇烈運動的過程中，腸內容物就可能會刺激腸道黏膜，出現腹痛、腹瀉等癥狀，建議患者遵醫囑服用阿莫西林膠囊、奧美拉唑腸溶片等藥物進行治療。
除上述常見原因外，患者的問題還可能與其他因素有關，比如腸扭轉、腹腔積液、腸梗阻等，建議患者查明情況后及時處理。