吞口水后腦勺疼在臨床上是較常見的癥狀，一般由多種因素導致，可能與勞累、緊張、壓力大等生理因素有關，也可能與扁桃體炎、咽喉炎、頸椎病、偏頭痛、腦梗塞等病理因素有關。
一、生理因素：當患者長時間精神壓力大、焦慮、緊張、疲倦勞累時，容易導致吞口水時對周圍神經造成刺激，從而出現后腦勺疼的癥狀。
二、病理因素：1、扁桃體炎：通常是由感染因素導致，以咽痛為主要癥狀，常伴有頭疼，咽喉干燥等癥狀，易反復發作引發并發癥如吞口水后腦勺疼；
2、咽喉炎：通常由病毒或細菌感染導致，會出現咽喉部灼熱、發癢、咽喉腫痛等癥狀，嚴重時會出現頭痛、發熱等全身癥狀，可能會引起吞口水后腦勺疼；
3、頸椎病：出現吞咽口水后腦勺疼的情況時，要注意觀察是否伴有肩頸部位的不適感，以及一側手臂的麻木癥狀。如果出現這種情況，提示可能與頸椎疾病有關，建議完善相關檢查來進行診斷；
4、偏頭痛：吞口水時后腦勺疼，可能與偏頭痛有關。確診后可在醫生的指導下使用谷維素片、維生素B6片等藥物進行治療；
5、腦梗塞：由于堵塞導致腦血管受壓水腫，引起顱內壓升高，使腦部血液循環出現障礙，從而導致患者出現吞口水后腦勺疼的癥狀。
吞口水后腦勺疼的原因較為復雜，如果癥狀持續存在，應及時去醫院進行相應檢查，查明原因后積極處理。