九價HPV疫苗是肌肉注射而不是皮下注射。若接種部位有炎癥、過敏、皮膚外傷破損，或出現其他皮膚病的情況下，可暫緩接種，建議治愈后再考慮接種九價HPV疫苗。
九價HPV疫苗注射部位一般選擇上臂三角肌處，因為藥物注入到肌肉后毛細血管會吸收藥物，從而進入到靜脈，通過血液循環而進入全身各個組織。而上肢活動比較多，所以會促進血液循環，使藥物被更好吸收，所以九價HPV疫苗選擇肌肉注射而不是皮下注射。
接種九價HPV疫苗一定要嚴格掌握適應證和禁忌證，一共需要接種三針才可起到有效預防作用，成功率可達90%以上，并且接種完九價HPV疫苗疫后仍需要定期做宮頸癌篩查。