嬰兒膽汁淤積一般不能自愈，建議家長及時帶嬰兒前往醫院的兒科或新生兒科就診，根據具體病情，在醫生指導下選擇合適的方案進行治療。
嬰兒膽汁淤積主要是由于肝細胞性膽汁分泌或排泄障礙所導致，比如嬰兒由于遺傳因素導致體內某種代謝酶減少，使代謝途徑發生阻滯，當代謝產物在肝臟累積，導致肝臟損傷，會引起膽汁淤積。另外，如果嬰兒存在膽道閉鎖、先天性肝內膽管擴張、膽管狹窄等疾病，也可能會影響膽汁的排泄，進而導致膽汁淤積。而這些病因均無法自行痊愈，因此，嬰兒出現膽汁淤積后，需要積極根據具體病因進行針對性的治療。
如果是感染引起的，可以遵醫囑使用注射用頭孢曲松鈉、注射用哌拉西林鈉等藥物進行抗感染治療。如果是由先天性膽道閉鎖導致，則需要進行膽汁分流術治療，避免加重肝損傷程度。治療期間，家長需要觀察嬰兒的大小便情況，如果進行手術治療，術后需堅持母乳喂養。若母乳不足，可以加用配方奶，以補充嬰兒身體恢復所需的營養物質，有利于身體恢復。